1.通過Cydia下載的deb包在/var/cache/apt/archives/目錄中，一般情況下，程序在安裝完成后其deb包會被自動清除，若出現了未被自動清除的已安裝deb包，可以手工刪除。方法，直接刪除此目錄中擴展名為.deb的文件。

2.通過Cydia安裝的程序都在/private/var/stash/Applications/目錄，這里的文件夾名稱都一目了然。如果刪除deb軟件時出現刪除不干凈的情況，可以在此找到你要刪除的軟件夾，直接將其刪除。前提是已經在Cydia中已經刪除一遍了，但是沒刪除干凈的情況，也就是你在這些文件夾里發現了一個你已經刪除的軟件，但是還留有它的文件夾。

3、進入/var/lib/apt/lists然后刪掉此文件夾下的所有文件(文件夾不刪)，該目錄下的partial文件夾下的內容也刪除，但要保留這個空文件夾。

4、進入/etc/apt/sources.list.d目錄，刪除該目錄下的cydia.list，里面有你手動添加的源的列表，是備份用的，可編輯，選擇性刪除。

【特別提醒：】如果你知道是哪個源給你造成的麻煩(一般cydia會有告警)，那在上面2個步驟中，你可以只刪除這個麻煩的源，這樣就不必全部重新添加源了。

一般完成到這步就可修復cydia，如果不行請繼續執行以下步驟。

5、進入/var/lib/dpkg/updates目錄，將該目錄下的所有文件刪掉，就可以修復cydia。

6、刪除var/lib/cydia/metadata.plist文件，這個是保存所有添加過的源的信息。有些頑固的信息藏在這里，前面3步就算全部執行，在重新進入cydia，再添加源的時候，metadata.plist會再次起作用，將頑固信息再次復原，這樣又導致cydia崩潰。因此刪掉它是一個比較根本的解決辦法。